مقاله انگلیسی رایگان در مورد تحلیل تکاملی ژنوم کامل کرونا ویروس جدید (۲۰۱۹-nCoV) – الزویر ۲۰۲۰

elsevier

 

مشخصات مقاله
ترجمه عنوان مقاله تحلیل تکاملی ژنوم کامل کرونا ویروس جدید (۲۰۱۹-nCoV) در ابطال فرضیه ظهور به عنوان نتیجه ترکیب مجدد رویداد اخیر
عنوان انگلیسی مقاله Full-genome evolutionary analysis of the novel corona virus (2019-nCoV) rejects the hypothesis of emergence as a result of a recent recombination event
انتشار مقاله سال ۲۰۲۰
تعداد صفحات مقاله انگلیسی ۴ صفحه
هزینه دانلود مقاله انگلیسی رایگان میباشد.
پایگاه داده نشریه الزویر
نوع نگارش مقاله
مقاله کوتاه (Short Communication)
مقاله بیس این مقاله بیس نمیباشد
نمایه (index) Scopus – Master Journals List – JCR – MedLine
نوع مقاله ISI
فرمت مقاله انگلیسی  PDF
ایمپکت فاکتور(IF)
۲٫۶۷۰ در سال ۲۰۱۹
شاخص H_index ۷۴ در سال ۲۰۲۰
شاخص SJR ۱٫۲۰۸ در سال ۲۰۱۹
شناسه ISSN ۱۵۶۷-۱۳۴۸
شاخص Quartile (چارک) Q2 در سال ۲۰۱۹
مدل مفهومی ندارد
پرسشنامه ندارد
متغیر ندارد
رفرنس دارد
رشته های مرتبط پزشکی
گرایش های مرتبط ویروس شناسی پزشکی، پزشکی داخلی، اپیدمیولوژی، بیماری های عفونی و گرمسیری
نوع ارائه مقاله
ژورنال
مجله  عفونت، ژنتیک و تکامل – Infection, Genetics and Evolution
دانشگاه  National and Kapodistrian University of Athens, Athens, Greece
کلمات کلیدی کرونا ویروس جدید – تحلیل توالی ژنومی، تحلیل فیلوژنتیک، ترکیب مجدد، منشا، اپیدمیولوژی مولکولی
کلمات کلیدی انگلیسی Novel coronavirus, Genomic sequence analysis, Phylogenetic analysis, Recombination, Origin, Molecular epidemiology
شناسه دیجیتال – doi
https://doi.org/10.1016/j.meegid.2020.104212
کد محصول E14555
وضعیت ترجمه مقاله  ترجمه آماده این مقاله موجود نمیباشد. میتوانید از طریق دکمه پایین سفارش دهید.
دانلود رایگان مقاله دانلود رایگان مقاله انگلیسی
سفارش ترجمه این مقاله سفارش ترجمه این مقاله

 

فهرست مطالب مقاله:
Abstract

Declaration of Competing Interest

References

بخشی از متن مقاله:
Abstract

Background: A novel coronavirus (2019-nCoV) associated with human to human transmission and severe human infection has been recently reported from the city of Wuhan in China. Our objectives were to characterize the genetic relationships of the 2019-nCoV and to search for putative recombination within the subgenus of sarbecovirus.

Methods: Putative recombination was investigated by RDP4 and Simplot v3.5.1 and discordant phylogenetic clustering in individual genomic fragments was confirmed by phylogenetic analysis using maximum likelihood and Bayesian methods.

Results: Our analysis suggests that the 2019-nCoV although closely related to BatCoV RaTG13 sequence throughout the genome (sequence similarity 96.3%), shows discordant clustering with the Bat_SARS-like coronavirus sequences. Specifically, in the 5′-part spanning the first 11,498 nucleotides and the last 3′-part spanning 24,341–۳۰,۶۹۶ positions, 2019-nCoV and RaTG13 formed a single cluster with Bat_SARS-like coronavirus sequences, whereas in the middle region spanning the 3′-end of ORF1a, the ORF1b and almost half of the spike regions, 2019-nCoV and RaTG13 grouped in a separate distant lineage within the sarbecovirus branch.

Conclusions: The levels of genetic similarity between the 2019-nCoV and RaTG13 suggest that the latter does not provide the exact variant that caused the outbreak in humans, but the hypothesis that 2019-nCoV has originated from bats is very likely. We show evidence that the novel coronavirus (2019-nCov) is not-mosaic consisting in almost half of its genome of a distinct lineage within the betacoronavirus. These genomic features and their potential association with virus characteristics and virulence in humans need further attention.

ارسال دیدگاه

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *